Den utvivlsomt største forvekslingsmulighed er den nærtstående hedemøgbille (Aphodius coenosus), som dog har et plumpt 1. fodled, stærkt udvidede bagskinneben og en bred øverste endespore på disse. Derudover har lille møgbille fladere kinder og punktstriberne på dækvingerne er mere tydeligt markerede. Hedemøgbille har også en længdekøl på scutellum, som lille møgbille mangler.Flere af de mindre mørke arter i slægten ligner lille møgbille en del. Rødhalet møgbille (Aphodius haemorrhoidalis) adskiller sig ved at være afrundet, bredere og mere “buttet” i udtrykket. Den har desuden mørkere ben, større scutellum og mere rød dækvingespids. Aphodius nemoralis adskilles fra lille møgbille ved at dækvingerne er tydeligt bredest bagtil, samt at pronotum er langt smallere i forhold til dækvingerne. Lille jordmøgbille (Aphodius plagiatus) og Aphodius niger er væsentligt mindre og mere slanke. Aphodius granarius har langt mere afrundede sider på pronotum og kan have lyse dækvingespidser. Derudover har pronotum på Aphodius granarius mere sparsom punktur. Kort møgbille (Aphodius brevis) er mere bred og højere hvælvet. Sværhedsgraden for en bestemmelse af det voksne individ synes at være relativt høj. Larven er svær at kende og kræver høj ekspertise.

Arten er monofag og kan træffes i især ko-, hjorte- og fåregødning. Den lever ofte i de lidt tørre fraktioner af gødningen, ofte i overgangen mellem skorpe og den mere flydende indmad. Den lever primært af tarmsaft og andre let-omsættelige næringsstoffer, der ikke er blevet optaget gennem fordøjelsen af pattedyret. Arten overvintrer som imago, og æglægningen finder sted i gødningen, når dyrene kommer frem i april. Denne generation fortsætter til cirka primo juni, og anden generation kommer frem i medio-primo juni og de sidste individer ses i primo august. Den sværmer i godt og stille vejr, primært i starten af forekomstperioden. Arten er byttedyr for mange rovdyr i og omkring gødningskagen. Især fugle præderer på den, men også andre insekter, herunder primært mens den er larve. Et klassisk insekt, der præderer på den, er stor gødningsrovflue (Asilus crabroniformis), der også tager voksne individer.

Lille møgbille findes i forskellige typer græsland og på heder, hvor der går græssende dyr.

Lille møgbille er udbredt i Danmark, og kan ikke kaldes helt almindelig, men er heller ikke decideret sjælden. Den findes pletvist eller koncentreret udbredt i alle faunistiske distrikter.

Danmarks Billebank

Den Danske Rødliste

Gittings, T. & P.S. Giller, 1997: Life history traits and resource utilisation in an assemblage of north temperate Aphodius dung beetles (Coleoptera: Scarabaeidae)

Hansen, V. 1925. Danmarks Fauna bd. 29. Biller VI. Torbister

Hansen, V. 1964. Fortegnelse over Danmarks biller (Coleoptera). Entomologiske Meddelelser 33: 1-507, inkl. tillægsbind

Roslin, R., G. Liljeberg, M. Forshage, C. Ekblad & F. Ödegaard. 2014. Nordens dyngbaggar