Kan forveksles med mange af de mindre mørke møgbiller. Rødhalet møgbille (Aphodius haemorrhoidalis) adskiller sig ved at være generelt mere afrundet, og mere “buttet” i udtrykket. Den har desuden større scutellum og en mere eller mindre tydelig rød dækvingespids. Aphodius nemoralis adskilles fra kort møgbille ved at have mere glatte, ikke så hvælvede dækvinger. Desuden er Aphodius nemoralis også mere svagt rødbrun i grundfarven, hvilket især kan ses på de mere rødlige ben. Lille jordmøgbille (Aphodius plagiatus) og Aphodius niger er væsentligt mindre og mere slank. Hedemøgbille (Aphodius coenosus) og Lille Møgbille (Aphodius plagiatus) har ikke så kraftig punktur og dybe punktstriber som kort møgbille. Desuden har brevis mere kantet pronotum og hoved samt en bredere krop.

Sværhedsgraden for en bestemmelse af det voksne individ synes at være relativt lav. Larven er svær at kende og kræver høj ekspertise.

Arten er monofag, og lever næsten udelukkende i ko- og fåregødning, hvori larven udvikler sig til puppe, og ultimativt til imago. I Sverige er den dog fundet i hjortegødning, og i Centraleuropa foretrækker den kaningødning. Imago ses primært fra ultimo maj til medio juli, hvor den sværmer i godt og stille vejr, primært i starten af forekomstperioden. Hunnen lægger æg midt i lorten. Der forekommer én generation om året. Imago er observeret overvintrende i opskyl. Arten er byttedyr for mange rovdyr i og omkring gødningen. Især fugle præderer på den, men også andre insekter, herunder primært mens den er larve. 

Den lever udelukkende i de helt tørre dele af gødningen, primært i gødning, der ligger oven på bart sand. Den nemmeste måde at eftersøge arten, er ved at fylde en murerbalje med gammel kolort, der ligger eksponeret på åben sandbund. Derefter skal alle kagerne brydes i meget fine små stykker, på størrelse med centicubes eller mindre, inden de dækkes af vand i murerbaljen. Herefter vil møgbillerne søge opad mod overfladen, herunder også kort møgbille. 

Kort møgbille har sandsynligvis altid været mere eller mindre sjælden i Danmark. Den er kendt fra tre faunistiske distrikter, herunder SJ, NEJ og NEZ. I nyere tid er de sikreste findesteder ved Lodskovvad - cirka 1,5 kilometer øst for Råbjerg Kirke, og derudover også Halk Skydeterræn, hvor den udover i gødning også er fundet i opskyl.

Danmarks Billebank

Den Danske Rødliste

Gittings, T. & P.S. Giller, 1997: Life history traits and resource utilisation in an assemblage of north temperate Aphodius dung beetles (Coleoptera: Scarabaeidae)

Hansen, V. 1925. Danmarks Fauna bd. 29. Biller VI. Torbister

Hansen, V. 1964. Fortegnelse over Danmarks biller (Coleoptera). Entomologiske Meddelelser 33: 1-507, inkl. tillægsbind

Roslin, R., G. Liljeberg, M. Forshage, C. Ekblad & F. Ödegaard. 2014. Nordens dyngbaggar