Almindelig ene er et nåletræ, der forekommer som flerstammet busk eller enkeltstammet træ. Arten er kendetegnet ved sine meget spidse nåle, der forekommer i 3-tallige kranse. Nålenes overside er blågrøn, og undersiden er mørkegrøn. Dens bark er tyk og grå til rødlig brun. Barken falder af i lange smalle strimler med alderen. Oftest er almindelig ene tvebo, hvor individer enten har han- eller hunblomster. Hanblomsterne er gule og iøjefaldende, hvor hunblomsterne er grønlige og ret uanselige. Arten har bærkogler. Kogleskællene er sammenvoksede, saftige og kødet.