Hører til blandt de store flagermus. Mørkebrun med lyse hårspidser, deraf navnet. Lysere underside. Kropslængde ca. 6 cm, vingefang ca. 30 cm, vægt 10-18 g.

Høres bedst med detektor omkring 25 kHz. Skimmelflagermusens skrig minder om sydflagermusens skrig, men skimmelflagermusens skrig har en langsommere rytme på ca. 5 skrig per sekund. Om efteråret høres artsspecifikke sociale lyde/revirsang. Disse lyde høres oftest i bymæssige områder. Den lave frekvens gør, at de sociale lyde kan høres med det blotte øre.

Sonogram: Ekkolokaliseringsskrigene har størst energi ved 25 kHz. Skrigenes krumning er anderledes og større end hos sydflagermus. Skrigets startfrekvens afhænger af terrænet. Hannernes revirsang, der høres i lange perioder om efteråret, har en kompliceret opbygning og er kraftige ned til 14 kHz, altså i det hørbare område for unge mennesker. Observerer man denne lyd, er man sikker på artsbestemmelsen.