Kongeørnen er den næststørste rovfugl i Danmark. Vingeforkanten på de meget lange vinger er lige, og vingebagkanten buer udad. Halen er lang. Den voksne kongeørn er mørkebrun i grundfarven. Sving- og halefjer er grå og har mørke tværgående bånd, og for enderne sidder et bredt sort bånd. Hos ungfuglene ses tydelige store hvide felter på halen og nær håndsvingfjerene. Brystet og forreste del af undervingen er lyst rødbrune. I flugten ser kongeørnen meget elegant ud. Den flyver med udspredte håndsvingfjer, der peger let opad. Den svæver igennem luften, og foretager med jævne mellemrum kraftige vingeslag. Kongeørnen bliver 80 cm lang, med et imponerende vingefang på 190-227 cm. Hannerne vejer 2850-4500 gram og hunnerne 3850-6700 gram.